1 Introdução

CRAN status Lifecycle: stable Downloads Total Downloads

Realiza a análise de delineamentos experimentais inteiramente casualizados (DIC), blocos casualizados (DIC) e quadrado latino (DQL), experimentos em esquema fatorial duplo e triplo (em DIC e DBC), experimentos em esquema de parcela subdividida (em DIC e DBC), parcela subsubdividida em DBC, análise conjunta de experimentos em DIC e DBC, análise de regressão linear e logístico, teste para duas amostras. O pacote realiza análise de variância, suposições ANOVA e teste de comparação múltipla de médias ou regressão, segundo Pimentel-Gomes (2009, ISBN: 978-85-7133-055-9), teste não paramétrico (Conover, 1999, ISBN: 0471160687), teste para duas amostras, análise conjunta de experimentos de acordo com Ferreira (2018, ISBN: 978-85-7269-566-4), Anova de ranks alinhadas (Wobbrock, JO, Findlater, L., Gergle, D., & Higgins , JJ (2011), <doi: 10.1145 / 1978942.1978963>) e modelo linear generalizado (glm) para binomial e família Poisson em DIC e DBC (Carvalho, FJ (2019), <doi: 10.14393 / ufu.te.2019.1244>) . Também pode ser utilizado para obter medidas descritivas e gráficos, além de correlações e gráficos criativos usados nas ciências agrárias (Agronomia, Zootecnia, Ciência dos Alimentos e áreas afins).

1.1 Descrições gerais

Version: 1.2.0

Depends: R (≥ 3.6.0)

Imports: ggplot2, lmtest, nortest, ScottKnott, lme4, crayon, grid, gridExtra, stringr, Hmisc, emmeans, ARTool, multcomp, ggrepel, reshape2, MASS, cowplot, multcompView, hnp, RColorBrewer, drc

Suggests: DT, knitr, rmarkdown, roxygen2

Published: 2021-06-14

Author: Gabriel Danilo Shimizu ORCID iD [aut, cre], Rodrigo Yudi Palhaci Marubayashi ORCID iD [aut, ctb], Leandro Simoes Azeredo Goncalves ORCID iD [aut, ctb]

Maintainer: Gabriel Danilo Shimizu

License: GPL-2 | GPL-3 [expanded from: GPL (≥ 2)]

NeedsCompilation: no

Materials: NEWS

Reference manual: AgroR.pdf

1.2 Lista de funções

1.2.1 Conjunto de dados

  • aristolochia: Germination of seeds of Aristolochia sp. as a function of temperature.
  • cloro: Sodium dichloroisocyanurate in soybean
  • emerg: Emergence of passion fruit seeds over time .
  • enxofre: Sulfur data
  • laranja: Orange plants under different rootstocks
  • mirtilo: Cutting blueberry data
  • passiflora: Substrate data in the production of passion fruit seedlings
  • phao: Osmocote in Phalaenopsis sp.
  • pomegranate: Pomegranate data
  • porco: Pig development and production
  • sensorial: Sensorial data
  • simulate1: Simulated data dict
  • simulate2: Simulated data dbct
  • simulate3: Simulated data dqlt
  • tomate: Tomato data
  • weather: Weather data

1.2.2 Funções para análise exploratória dos dados

  • desc: Descriptive analysis
  • desc2fat: Descriptive analysis (Two factors)
  • desc3fat: Descriptive analysis (Three factors)
  • dispvar: Boxplot with standardized data
  • tabledesc: Table descritive analysis

1.2.3 Funções de análise

Análise ara teste de duas amostras independentes ou dependentes por método paramétrico ou não-paramétrico

  • test_two: Test for two samples

Análise de experimento simples

  • DIC: Completely randomized design
  • DBC: Randomized block design
  • DQL: Latin square design

Análise de experimentos simples em DIC e DBC por modelo linear generalizado (Binomial ou Poisson)

  • DIC.glm: Completely randomized design by glm
  • DBC.glm: Randomized block design by glm

Análise de experimentos em DIC, DBC ou DQL com múltiplas avaliações no tempo ou desconsiderando o efeito de outro fator.

  • DICT: Completely randomized design evaluated over time
  • DBCT: Randomized block design evaluated over time
  • DQLT: Latin square design evaluated over time

Análise de grupos de experimentos em DIC e DBC

  • conjdbc: Joint analysis of experiments in randomized block design
  • conjdic: Joint analysis of experiments in completely randomized design

Análise de experimentos em esquema fatorial duplo em DIC e DBC

  • FAT2DIC: DIC experiments in double factorial
  • FAT2DBC: DBC experiments in double factorial

Análise de experimentos em esquema fatorial duplo em DIC ou DBC com um tratamento adicional

  • FAT2DIC.ad: DIC experiment in double factorial design with an additional treatment
  • FAT2DBC.ad: DBC experiment in double factorial design with an additional treatment

Análise de experimentos em esquema fatorial duplo em DIC ou DBC por método não-parametrico de Anova de ranks alinhados.

  • FAT2DIC.art: Analysis of Variance of Aligned Rank Transformed Data in FAT2DIC
  • FAT2DBC.art: Analysis of Variance of Aligned Rank Transformed Data in FAT2DBC

Análise de experimentos em DIC ou DBC em esquema fatorial com três fatores

  • FAT3DIC: DIC experiments in triple factorial
  • FAT3DBC: DBC experiments in triple factorial

Esquema de parcelas subdivididas em DIC ou DBC

  • PSUBDBC: DBC experiments in split-plot
  • PSUBDIC: DIC experiments in split-plot

Esquema de parcelas subsubdivididas em DBC

  • PSUBSUBDBC: DBC experiments in split-split-plot

Teste de Dunnett para comparação de testemunha vs tratamentos

  • dunnett: Dunnett test

Regressão logistica de 3 ou 4 parâmetros

  • logistic: Logistic regression

Regressão polinomial até terceiro grau

  • polynomial: Linear regression graph
  • polynomial2: Linear regression graph in double factorial
  • polynomial2_color: Linear regression graph in double factorial with color graph

1.2.4 Gráficos

  • barplot_positive: Positive barplot
  • bar_graph: bar graph for one factor
  • corgraph: Correlogram
  • cor_ic: plot Pearson correlation with interval of confidence
  • line_plot: Line chart
  • plot_cor: plot correlation
  • plot_interaction: Interaction plot
  • plot_jitter: Column, box or segment chart with observations
  • plot_TH: Climate chart of temperature and humidity
  • plot_TH1: Climate chart of temperature and humidity (Model 2)
  • radargraph: Circular column chart
  • seg_graph: segment graph for one factor
  • sk_graph: Scott-Knott graphics
  • spider_graph: Spider graph for sensorial analysis
  • TBARPLOT.reverse: Reverse graph of DICT, DBCT and DQL output when geom=“bar”

1.2.5 Funções úteis

  • sketch: Experimental sketch
  • aacp: Area under the curve
  • transf: Data transformation (Box-Cox, 1964)